这项研究显示了南美白对虾在温室和虾菜共生系统之间，肠道微生物群和水微生物群的差异。
一、肠道微生物对于养虾的影响
鱼菜共生系统的特点是水生动物、植物和生物絮团之间的共生关系，细菌负责将水中的废物转化为植物可以吸收的营养物质，从而提高养分去除效率并支持蔬菜生产。近年来，鱼菜共生系统成为研究热点，尤其是淡水鱼。
然而，目前还没有关于南美白对虾 (Litopenaeus vannamei) 和各种蔬菜在微咸水条件下（盐度5-15ppt）的虾菜共生系统的报道。在本研究中，在10ppt盐度条件下，南美白对虾( Litopenaeus vannamei )和宁夏枸杞（Lycium barbarum）虾菜共生养殖模式。
二、研究环境
1、虾样本取自温室养殖池 (WG) 和虾菜共生 (YG) 池塘、水样（WE、YE），并研究了两种养殖方法之间的肠道微生物群和水。
2、来自商业对虾孵化场的虾，在温室系统中以400尾虾/平方米的密度进行养殖，在虾菜共生系统中以1000尾虾/平方米的密度养殖，养殖60天后，从温室 (WG) 和虾菜共生(YG) 池塘收集水和虾肠道样本，体型从11.9到12.7厘米。以多种方式分析了虾肠和水样。
图1：温室和虾菜共生的养殖环境
(a) 温室池塘的外部结构；(b) 温室池塘的内部结构；(c) 虾菜共生池塘；(d) 虾菜共生的植物。
三、研究结果
1、分析结果表明，水中的微生物多样性（WE、YE）明显高于肠道微生物群（WG、YG）。这表明虾肠道微生物群主要来自周围的水生环境，并可能作为抵御水生微生物群的屏障。
2、在门类别上，WE和WG之间的统计分析表明，变形菌门（Proteobacteria）、放线菌门(Actinobacteriota)、拟杆菌门（Bacteroidota)、Patescibacteria和绿弯菌门(Chloroflexi)为主要细菌。其他研究人员此前曾报道，变形杆菌、厚壁菌门、放线菌和许多其他细菌，通常存在于南美白对虾及其周围环境中。在这项研究中，变形杆菌和放线菌是两种养殖方案中最常见的细菌。
3、在属水平上，WE和WG之间的分析表明， Amaricoccus、Micrococcales、Flavobacteriaceae和Paracoccus是优势细菌属，而Acinetobacter、Demequina和Rheinheimera是YE和YG之间的优势细菌属，这表明温室和虾菜共生制度之间的核心菌群明显不同。细菌属Amaricoccus、Paracoccus和Tessaracoccus在WE和WG之间更常见，Amaricoccus和Paracoccus是典型的好氧硝化细菌，能够降解多种有机化合物并将硝酸盐转化为氮气。
4、分析结果表明，水中的微生物与水生动物的微生物群落相互作用。具体而言，温室系统中虾肠道微生物群与水之间的相互作用，比虾菜共生系统中的更强。然而，氮循环没有影响。这表明YE和WE组中的自养和异养反硝化作用，能够有效去除水中的废物残留物。
5、YG组具有更高丰度的不动杆菌，这是机会性病原体此外，根瘤菌是一种通常存在于YG组植物根部的共生细菌，这表明虾肠道微生物群与植物根部的细菌相互作用。
四、研究观点
研究人员比较了来自温室 (WG) 和虾菜共生 (YG) 的虾样本和水样 (WE, YE) 的微生物群，以确定温室和虾菜共生系统之间的微生物种群差异。结果表明，两种养殖体系对虾肠道微生物群和水体微生物群的特异性多样性基本没有差异。然而，当在门和属水平上分析时，温室系统中的肠道微生物群和水生环境，与虾菜共生系统中的不同。
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