新疆地区猪圆环病毒流行病学调查及感染情况分析

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原文标题：Epidemiological investigation and analysis of the infection of porcine circovirus in Xinjiang

本研究的目的是了解新疆地区猪圆环病毒（porcine circovirus, PCV）的分布，同时分析PCV2和PCV3的遗传多样性。本研究自2022年8月至2024年1月，从新疆8个区域的22家猪场采集有呼吸窘迫、繁殖障碍的临床表现及因腹泻导致消瘦的猪的血液、肺、肝脏和淋巴结合计453份样本。经qPCR检测四种PCV的阳性率，并对部分PCV2和PCV3阳性样本进行测序分析和系统发育分析。

结果显示，PCV1、PCV2、PCV3和PCV4的阳性率分别是15%、71%、25%和17%（图 9a），各PCV混合感染情况如图9b，PCV2和PCV3混合感染率最高，达12.36%。

对PCV2的ORF2测序结果显示，分析的9个PCV2的序列分别属于PCV2e（1条）、PCV2b（4条）和PCV2d（4条）（图10a），9个ORF2序列间核酸相似度从81.8%至94.8%之间。氨基酸序列分析结果显示，相对于其他亚型，PCV2b和PCV2d均在抗原识别区发生了3个突变，除此之外PCV2b在NLS-B位点还有一个突变。本研究中测序的PCV2e相对于其他亚型也有2个氨基酸突变，与主要毒株PCV2d的抗原表位存在显著差异。

12条PCV3的ORF2序列分析显示，2条为PCV3a，10条为PCV3b（图10b），它们的相似性在95.5%至97.1%之间。氨基酸分析显示，PCV3a相对其他亚型有3个氨基酸突变，而PCV3b有4个突变。