圆环病毒的远房大块头表哥来了！

通过引物设计、全基因组扩增和测序拼接，科研人员最终获得了这个新病毒的完整基因组序列，结果让所有人都很意外。我们日常接触的猪圆环病毒，不管是 PCV2、PCV3 还是 PCV4，基因组长度基本都在 1700-2000 个核苷酸左右，而这个新病毒的基因组全长达到了 9426 个核苷酸，是目前已知所有同类病毒中基因组最大的，也正是因为这个特点，它被命名为 “猪巨圆环病毒”，简称 PMCV。

更关键的是，这个 “大块头” 和我们熟悉的圆环病毒，亲缘关系其实非常远。科研人员对病毒负责复制的核心 Rep 蛋白进行了序列比对，发现它和已知的 PCV1 到 PCV4，以及多种同类病毒的氨基酸序列同源性都极低，其中和同源性最高的 PCV4 相比，也只有 23.6% 的相似度。通过系统进化分析发现，这个新病毒不属于目前已知的任何一个圆环病毒所属的病毒科，是一个全新的病毒类群，说它是圆环病毒的 “远房表哥”，再贴切不过。

这样的检测结果，传递出了两个非常关键的信息。第一，PMCV 和母猪繁殖障碍有着极强的关联性，它最初在流产死胎中被发现，流行病学调查也再次证实，流产胎儿中有着较高的检出率，这和我们临床中遇到的 “不明原因繁殖障碍” 高度契合。第二，这个病毒主要存在于猪的粪便、口鼻分泌物中，这意味着它很可能通过消化道、呼吸道这些常见途径在猪群中传播，这也是我们日常防控中需要重点关注的环节。

虽然已经确认了 PMCV 是一种全新的病毒，也摸清了它的基本流行特征，但目前我们对这个新病原的认知，依然还有很多空白。首先，科研人员已经通过生化试验证实，PMCV 的 Rep 蛋白具备典型的同类病毒复制相关蛋白的结构和功能，拥有 ATP 酶活性，能形成和 PCV2 Rep 蛋白一致的六聚体结构，这也确定了它的病毒分类属性。但到目前为止，科研人员还没能成功分离出活的 PMCV 病毒粒子，这也意味着，我们还没法通过动物回归试验，100% 确认它就是导致母猪繁殖障碍的直接元凶，只能确定二者之间存在极强的临床关联性。

其次，这个病毒的关键结构蛋白还没有被找到。熟悉圆环病毒的朋友都知道，圆环病毒有两个核心蛋白，负责复制的 Rep 蛋白，和负责形成病毒外壳、诱导机体产生抗体的 Cap 蛋白。Cap 蛋白不仅是病毒入侵细胞的关键，也是我们研发疫苗、建立抗体检测方法的核心。但科研人员通过序列比对、结构预测等多种方式，都没能在 PMCV 的基因组中找到和经典 Cap 蛋白同源的序列，目前推测它的 Cap 蛋白可能藏在基因组中一段 GC 含量极高、难以测序的区域里，这也给后续的疫苗研发、检测方法建立带来了不小的挑战。

还有一个我们养猪人必须关注的点，就是现有圆环检测方法可能存在的误判风险。科研人员在试验中发现，针对 PMCV Rep 基因设计的定量 PCR 引物，会和 PCV2、PCV3 出现交叉反应；反过来，临床中也出现过用商品化 PCV2 抗原检测试剂盒检测为阳性，但常规 PCR 却扩不出 PCV2 全基因组，最终确认是 PMCV 阳性的案例。这就意味着，我们日常用的圆环检测试剂盒，可能会因为这个新病毒的存在，出现假阳性或者漏检的情况，而目前还没有一套稳定、特异的 PMCV 检测方法，这也是当下急需解决的问题。